De PThU verzorgt masteropleidingen aan al haar vestigingen.
De opleidingen zijn alle gericht op nadere specialisatie en kunnen in principe worden gevolgd na afronding van een universitaire bacheloropleiding (klassieke) theologie/godgeleerdheid. Mits aangevuld met een aantal noodzakelijke vakken, staan de opleidingen echter ook open voor studenten met andere vooropleidingen.

Deeltijd
De meeste opleidingen zijn ook in deeltijd te volgen.
Kijk voor meer informatie hierover op de pagina's van de verschillende opleidingen. In het onderstaande wordt uitgegaan van de voltijdse omvang.
 

Eenjarige masteropleiding

• Master Verdieping (vestiging Kampen) In deze master kun je je nader specialiseren in een van de klassieke deeldisciplines van de theologie.  

De eenjarige masteropleiding van de PThU staat in principe open voor bachelors in de godgeleerdheid die zijn opgeleid aan de PThU, aan de Universiteit Leiden, de Universiteit Utrecht, de Rijksuniversiteit Groningen en de Vrije Universiteit te Amsterdam. 
In een aantal gevallen zal rekening gehouden moeten worden met specifieke inhoudelijke eisen die per opleiding worden aangegeven.
  

Driejarige masteropleidingen
De driejarige predikantsmasters leiden op tot predikant in de Protestantse Kerk in Nederland. Daarbij wordt onderscheid gemaakt tussen de gemeentepredikant en de predikant-geestelijk verzorger.
De opleidingen bevatten naast wetenschappelijke verdieping een uitgebreid aanbod aan beroepsvoorbereidende vakken en stages, waarin theorie en praktijk in wisselwerking worden bestudeerd en geoefend.

• Master Predikantschap  Kampen
   
• Master Geestelijke verzorging  Kampen
   
• Master Gemeentepredikant  - Utrecht  & Leiden  
   
  • De predikantsmasters van de PThU staan open voor bachelors en masters in de godgeleerdheid die zijn opgeleid aan de PThU, aan de Universiteit Leiden, de Universiteit Utrecht, de Rijksuniversiteit Groningen en de Vrije Universiteit te Amsterdam. Deze opleidingen voldoen in principe aan de toelatingseisen die voor de verschillende masteropleidingen van de PThU zijn opgesteld. In een aantal gevallen zal bij de invulling van het bachelor- dan wel masterprogramma echter rekening gehouden moeten worden specifieke inhoudelijke eisen voor een aantal theologische disciplines.
  • Voor instromers van HBO-opleidingen theologie en instromers met ándere universitaire vooropleidingen dan een bachelor of master godgeleerdheid, zijn specifieke toelastingseisen geformuleerd.
  • Indien een afgeronde eenjarige universitaire masteropleiding godgeleerdheid voldoet aan alle toelatingseisen, wordt binnen de predikantsmaster een vrijstelling met de omvang van 60 ects verleend.
     
• Honoursprogramma  -  Utrecht, Kampen & Leiden
  Deels binnen en deels naast het programma van de driejarige predikantsmasters is het mogelijk om een honoursprogramma te volgen.
  Dit programma biedt goede studenten de mogelijkheid hun onderzoekscapaciteit intensief te ontwikkelen met het oog op een mogelijke promotieplaats ná de predikantsmaster. Op het niveau van een researchmaster wordt hierin extra aandacht besteed aan één (sub-)discipline van de theologie en aan onderzoeksmethodologie. 
   

Voor een overzicht van de toelatingseisen en/of vrijstellingsregelingen voor de driejarige predikantsmasters van de PThU, zie de pagina toelatingseisen predikantsmasters.